薛生白是我国医学史上难得的名医，从资料分析来看，他并没有拜师某名医门下，而是自学成才的医生。
究其成才的原因，主要有两个方面。首先薛生白具备坚实的古文基础，而且他刻苦好学，广博寻才，触类旁通，对经典著作和各学说都能有深入的了解，所谓的“秀才学医，如菜作齑”，就是这个道理。其次他天资聪慧，悟性高，古语称“医者，意也”。这个“意”，不是“臆测”，而是思想活动，是对各种文献和事物的学习、观察、思考、自觉的过程。
薛生白与苏州名医“吴蒙”等人合作整理《王晋三》中的“绛雪园古方选注”，在学校专辑中发行《周扬俊》中的“温热暑疫全书”第4卷。通过两位吴中名医著作的校集、整理和讨论，这对薛生白的医疗实践和编著《湿热论》大有裨益。
薛生白的学术思想，主要结合医学与经学、《易学、文学等进行研究，开阔视野，牢牢抓住了“远取”、“近取”的中医学主题。他在《内经知要》的序文中说“要知道这条路的源头，来源于轩皇君臣，以羲皇一画的宗旨，整天详细论述世间疾病的原因，告诉天下后世治法的理所当然。药物是炎帝不如，鞠躬经历，观察四点山川水土好，试验五金八石性，品尝水陆草木味，其毒无毒，寒热平，攻击以补缓急之用。各有遗书，轩皇者称为素问，灵枢，炎帝者称为本草因此，在薛生白的眼里，如果医生不知道医药的根源，最终就不能成为良医。
薛生白《日讲杂记》中又说：“在《易》的先天图中，干在上在南，在后天图中，干在下在西北，与《内经的意思正合，体用相互呈现，生成共著，人体生成小天地，《系辞》的释先天圆图云：《数数者按顺序，知者相反》。“数数者按序”，即后天之用，五行相生之意，“内经生命也有百年之说”来知者逆，即逆五行相克相生，轩岐治病秘旨。从后天图位向先天图位反方向走，就是金丹大道，起到收集5行的作用。余尝言人要得到一半的仙人身份，才能成为《名医》二字，真不是浪语。“
薛氏阴阳学说，万宗归一，认为非常重要。“医经充栋，不越阴阳，诚于体脏腑，察背腹、上下、表里、脉左右尺寸，浮沉数迟，时令春夏秋冬，岁运南政、北政、阴阳微，查其虚实，万病之本，咸归掌握，只在万卷富、寸中，不约，简单有据。”（《吴医汇讲）
他在诊断上，可以斩断疾病。在治疗上，可随手愈合。薛生白好友袁枚多次目睹他治病如此有效，对他的医术极为侧重。薛生白说：“我的医生就像你的诗一样，纯粹地以神来进行，人在房间里，即使我来到了天外”（清顾震涛《吴门补乘卷五）
薛生白博学多才的医疗家，既有孤傲的一面，也有谦虚好学的一面。84岁的高年，出版了李念莪先生的《内经知要》。他在这本书的序言中“余久老了懒了，丙子（乾隆21年）到了岁，竟然成了出院的老僧，不说这条路。有一天，偶然想起了云间李念莪老师编的各种书，只是《内经知要》比余向日编的《医经原旨》，尤觉近人，只得上下两卷，简单到要点，方便时为师，学不好鸡声灯影者，其胸中也可以有一点准则。“。
薛生白虽然有大胆和怀疑的一面，但很多地方都特别崇拜羡慕古人的学问、品德和心术。他在《一瓢诗话》中“实学不远于浮名，实学不远名者师今人不如师古人，有古人今人胜于古人学问之深，品量高，心术正确，其著作，能激发一时，垂世万世。今人决不如古人，即依端倪而见。古人才能如命。”喜欢海胆，那个人有点长，即推崇称赞。今人只怕一人上我，娼妇妒忌排队，不遗余力，虽有著，视此心术，天将厌之，尚希垂后乎“一段，薛生白并非好古空谈家，而是基于当时社会压抑人才的现实这说明了对时代发出的令人痛心的愤怒。